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主要有总大肠菌群、病毒、菌落总数三个指标。
1.总大肠菌群
指没升水样中所含有的大肠菌群的数目，以个/L计。大肠菌群数表明污水被粪便污染的程度。间接表明有肠道病菌存在的可能性。
2.病毒
大肠菌群数可以表明肠道病菌的存在，但不能表明是否污水中病毒。因此，还需检验病毒指标。病毒一般用噬菌体来表示数量。
3.菌落总数
菌落是指细菌在固体培养基上繁殖而形成的能被肉眼识别的生长物，它是由数以万计相同的细菌集合而成。当样品被稀释到一定程度，与培养基混合，在一定培养条件下，每个能够生长繁殖的细菌细胞都可以在平板上形成一个可见的菌落。
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